ในช่วงยุทธภูมิบริเตนชาวเยอรมัน กองทัพ เปิดตัวการโจมตีทางอากาศในเวลากลางคืนหนักในลอนดอน โดมของมหาวิหารเซนต์พอลถูกแทงด้วยระเบิดนาซีทิ้งแท่นบูชาสูงไว้ในซาก เป็นหนึ่งในไม่กี่ครั้งที่มหาวิหารศตวรรษที่ 17 ได้รับความเสียหายอย่างมากในระหว่างการบุกทิ้งระเบิดในเยอรมนีเมื่อปลายปี 2483
ตามธรรมเนียมแล้ววัดโรมันของเทพธิดาไดอาน่าที่ครั้งหนึ่งเคยยืนอยู่บนเนินเขา Ludgate ที่ตั้งของมหาวิหารเซนต์พอล ใน 604 A.D. King Aethelberht ฉันอุทิศโบสถ์คริสต์แห่งแรกที่นั่นให้กับ St. Paul มหาวิหารนั้นถูกเผาและการแทนที่ถูกทำลายโดยไวกิ้งในปี 962 มหาวิหารแห่งที่สามถูกทำลายด้วยไฟในปี 1087 และถูกแทนที่ด้วยโครงสร้างนอร์แมนที่ยิ่งใหญ่ซึ่งสร้างเสร็จในศตวรรษที่ 13 ในศตวรรษที่ 16 มหาวิหารที่สี่ตกลงไปในสภาพทรุดโทรมและได้รับความเสียหายจากไฟไหม้และความเสียหายอื่น ๆ เกิดขึ้นในช่วงสงครามกลางเมืองอังกฤษในศตวรรษที่ 17 ในปี 1660 Sir Christopher Wren สถาปนิกชาวอังกฤษได้รับการเกณฑ์ให้ซ่อมแซมโบสถ์ แต่ไฟไหม้ครั้งใหญ่ของกรุงลอนดอนได้เข้ามาทำลายวิหารเก่าของ St. Paul ในปี 1666
หลังจากไฟไหม้ Wren ได้ออกแบบมหาวิหารเซนต์พอลแห่งใหม่โดยมีโบสถ์ใหม่เล็ก ๆ หลายสิบแห่งซึ่งตั้งอยู่รอบ ๆ มันเหมือนดาวเทียม มหาวิหารแห่งนี้เป็นผลงานชิ้นเอกของ Wren ที่มีการออกแบบสไตล์บาร็อคและโดมที่โดดเด่นโอฬาร นกกระจิบตัวเองวางบล็อกรากฐานใน 1675 และใน 1,710 ใส่หินสุดท้ายในสถานที่ เมื่อสถาปนิกเสียชีวิตในปี 1723 เขาถูกฝังไว้พร้อมกับพิธีที่ยิ่งใหญ่ในเซนต์พอล คำจารึกใกล้หลุมฝังศพของเขาอ่าน Lector, si monumentum requiris, circumspice’ละตินสำหรับ“ Reader หากคุณแสวงหาอนุสาวรีย์ลองมองดูคุณ” ประชาชนชาวอังกฤษที่มีชื่อเสียงคนอื่น ๆ หลายคนมาร่วมงานกับเขาในห้องใต้ดินของเซนต์พอลรวมถึงวีรบุรุษทหารลอร์ดเนลสันและท่านดยุคแห่งเวลลิงตัน
มหาวิหารเซนต์พอลกลายเป็นแรงบันดาลใจให้กับชาวอังกฤษในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง ในการต่อสู้ของบริเตนพวกกองทัพพยายามที่จะวางระเบิดในอังกฤษโดยการทุบลอนดอนและเมืองใหญ่อื่น ๆ แต่เซนต์พอลก็หนีรอดพ้นจากความเสียหายจากการระเบิดครั้งใหญ่ได้อย่างน่าอัศจรรย์แม้อาคารประวัติศาสตร์ที่อยู่ใกล้จะถูกทำลายจนกลายเป็นซากปรักหักพัง รูปภาพของนักบุญพอลล้อมรอบไปด้วยควันและไฟกลายเป็นสัญลักษณ์ของจิตวิญญาณที่ไม่ย่อท้อของสหราชอาณาจักร กลุ่มป้องกันพลเรือนรวมถึงนาฬิกาไฟของเซนต์พอลป้องกันโครงสร้างจากไฟไหม้และเมื่อถึงจุดหนึ่งระเบิดที่ไม่มีการระเบิดก็ถูกกำจัดออกไปโดยมีความเสี่ยงสูงจากหลังคาของมหาวิหาร แม้จะมีความเสียหายเกิดขึ้นในคืนวันที่ 9 ตุลาคม 2483 มหาวิหารรอดชีวิตจาก การสงครามฟ้าแลบ ส่วนใหญ่ไม่บุบสลาย ในปีพ. ศ. 2487 ระฆังของเซนต์พอลดังขึ้นเพื่อเฉลิมฉลองการเปิดตัวของกรุงปารีสและในปี 1945 มีการทำเครื่องหมายจุดจบของสงครามในยุโรปโดยมีผู้เข้าร่วม 35,000 คน