คุณพ่อ Junipero Serra นักเผยแผ่ศาสนาชาวสเปนผู้ก่อตั้งคณะเผยแผ่คาทอลิกแห่งแรกในแคลิฟอร์เนียบนเว็บไซต์ของซานดิเอโกปัจจุบัน หลังจากเซอร์ร่าอวยพรด่านหน้าใหม่ของศาสนาคริสต์ในหมู่คนจำนวนมากมาตรฐานของสเปนก็คลี่คลายลงในภารกิจซึ่งเขาตั้งชื่อว่าซานดิเอโกเดออัลกาลา
เซอร์ร่ามาที่สเปนอเมริกาในปี 1750 และรับใช้ในภารกิจเซียร์รากอร์ดาจากนั้นก็อยู่ทางตอนใต้ของเม็กซิโก เขาเป็นผู้สอนศาสนาที่ประสบความสำเร็จเขาได้รับแต่งตั้งให้เป็นสมาชิกของการสำรวจดินแดนสเปนครั้งที่สองไปยังอัลตาแคลิฟอร์เนียในปี 1769 เมื่อพรรคมาถึงซานดิเอโก Serra ยังคงมีผู้ติดตามไม่กี่คนที่พบภารกิจแรกของแคลิฟอร์เนีย ส่วนที่เหลือของการสำรวจยังคงดำเนินต่อไปเพื่อค้นหาท่าเรือมอนเตร์เรย์ซึ่งก่อนหน้านี้เคยใช้โดยกะลาสีชาวสเปน แม้ว่านักสำรวจล้มเหลวในเป้าหมายของพวกเขา แต่ Serra ก็ประสบความสำเร็จในการค้นหามอนเทอเรย์ในปี 1770 และเขาก็ได้ก่อตั้ง San Carlos Barromeo ภารกิจที่สองขึ้นที่นั่น
ได้รับการแต่งตั้งเป็นประธานาธิบดีของอัลตาแคลิฟอร์เนีย presidios, Serra ในที่สุดก็ก่อตั้งทั้งหมดเก้าภารกิจทอดยาวจากซานดิเอโกจนถึงปัจจุบันซานฟรานซิสโก บรรพบุรุษของฟรานซิสกันสร้างชุมชนขนาดใหญ่รอบ ๆ ภารกิจสอนคริสเตียนพื้นเมืองอเมริกันให้ทำนาและเลี้ยงโคและควบคุมงานของพวกเขา ชุมชนเกษตรกรรมเหล่านี้มีความเป็นอิสระอย่างมากตั้งแต่แรกเจ้าหน้าที่อาณานิคมสเปนและจากนั้นรัฐบาลเม็กซิโก แต่ด้วยการมาของชาวอเมริกันในช่วงกลางศตวรรษที่ 19 ส่วนใหญ่ถูกทอดทิ้ง
